組改亂象一籮筐，
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，政大公共行政系教授施能傑表示，
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，組織改造並不會有「成功」、或是「完美無缺」的案例，
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，但政府推動組織改造至今已有三年餘卻尚未完成，
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，問題的核心是執政者無法有效推動自己的版本，
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，且內部對組改認知也沒擺平，便將法案送至立法院審查，造成行政院各部會紛紛到立法院遊說怪象。
施能傑說，若將政府比喻為一間房子，行政院下面的各部會是「房間」，而隸屬各部會之下的機關則像「床鋪」；以組改最初「縮減」、「兼併」的目的來看，行政院組織法規範部會要從卅七縮減為十九，連帶部會內的機關也減少。看似有大幅縮編，但行政效能卻未因此提升。
「房間變少了，可是床鋪擺對地方了嗎？」施能傑說，像核能安全管制局機關職責並非核能研發，應放在環資部，卻被列入科技部底下，就是「床鋪擺錯房間」的案例，導致組織改造未能發揮成效。
他說，目前組織改造未見政府效能提升；要精簡人力，也不見人員實質減少，僅看出人員轉移，只能稱為「組改完成第一階段整併」。他認為，「房間、床鋪」越少越好，且要有清楚的結構整合；他呼籲，組織改造既已上路，執政者更要強力捍衛自己的版本。
台大政治系副教授彭錦鵬表示，政府改造遇到最大的問題是中央政府權責劃分不清楚，目前討論「部」和「會」的組織運作、首長的身分地位類似，層級也尚未釐清，無法有效行政，造成組改效能不彰。
他建議，未來各部會組織法完成後，應檢討改組後部長和相關主管的權力和配置，且應加強部會「綜合規劃司」的功能；他說，組改的陣痛期難免，應盡速完成修法，再來檢視組改的成效。，