財團法人營運績效迭遭質疑，
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，立法院預算中心研究報告指出，
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，部分研發型法人近5年來，
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，竟完全無技轉收入或接受委託服務收入，
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，痛批其績效不彰，
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，商品化成效有限，
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，研發方向未能符合產業需求，
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，政府應儘速研議相關退場、整併機制。
報告指出，
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，如中華顧問工程司近5年來投入研發經費逐年遞增，
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，至101年度已高達9000萬餘元，但相關技術及專利移轉、研發技術移轉收入與委託案及工業服務收入，竟然全數掛「零」。
另外，台灣電子檢驗中心每年雖僅投入1、2千萬研發經費，也未見對產業界有任何技術移轉，或接受業界委託案及相關服務收入，顯然已失去提升產業競爭力的設置目的。
報告並指出，政府捐助成立16家研發型財團法人，每年約投入逾180億元研發經費，但每投入1塊錢所產生的技術移轉比率，竟低於0.16元以下，可見其研發技術效益偏低。
不僅如此，部分研發型法人在國內外專利布局上雖有斬獲，但實際用於移轉產業件數卻「寥寥無幾」，例如國家實驗研究院獲得國內外專利多達170餘件，應用件數只有10件，應用比率僅5.68％。
其餘像是國衛院、工研院、紡織產業綜合研究所及台灣動物研究所等，應用比率也低於5成以下，顯示其研發成果未能與產業相結合，導致空有取得專利權，卻無法有效協助國內產業升級、提升國際競爭力，並達到商品化目的。
預算中心抨擊，政府每年在科專預算中編數百億元補助或委辦經費，用以維持研發型法人營運，結果卻未能發揮應有研發能量，呼籲主管機關應令其轉型，並儘速建立退場與整併機制。，